Çiğ sütün bakteri yükünü azaltmak için farklı yöntemler uygulanmaktadır. Bunlardan en yaygın olarak tercih edilen yöntem ısıl işlem uygulamasıdır (Pastörizasyon, Termizasyon, Sterilizasyon v.b). Enerji tasarrufu ve sütün doğasında yer alan yararlı bakteriler ve diğer yararlı bileşenlerin mağruz kalması muhtemel olduğu etkileri ortadan kaldırmak amacıyla alternatif metodlara yönelim sonucu membran proses teknolojisi ön plana çıkmıştır.
Mikrofiltrasyon işlemi; çiğ süt alım noktasında veya proses esnasında uygulanabilmektedir (50-55 0C). Süt yağında bakteri birikimine sebep olabileceği göz önüne alınarak, öncelikle santrifüj seperatörler aracılığıyla süt yağının ayrıştırılarak, mikrofiltrasyon işleminin yağsız süte uygulanması ve ayrılan yağın süte tekrar karıştırılması önerilmektedir.
Mikrofiltrasyon işleminde süt; 0,4-1,4 μm ebatlarindaki porlardan oluşan seramik membranlara gönderilir. Bakteriler porlardan geçemeyerek alı konulurken, diğer süt bileşenleri (protein-karbonhidrat-mineral v.b) membran porlarından geçmekte, böylece süt bakterilerden arındırılmaktadır.
